Varhany gotickým chrámem zní od roku 1733, při požáru v dubnu 2019 nástroj nezasáhly plameny a téměř ani voda při hašení. Na varhanách se však usadil olověný prach a poškodily ho vysoké teploty v červenci 2019. Oprava přímo na místě by nebyla možná. Restaurátoři proto uvnitř katedrály postavili 30metrové lešení, ze kterého varhany po částech sundávali a díly odvezli ve čtyřech přepravních kontejnerech do skladu poblíž Paříže.
Celou opravu katedrály Notre-Dame řídí za tímto účelem speciálně zřízený úřad při ministerstvu kultury EPRNDP. Ten v první polovině příštího roku vypíše výběrové řízení na společnost nebo společnosti, které budou pověřeny čištěním, restaurováním a opětovnou montáží varhan. Vše by mělo být hotovo na slavnostní mši 16. dubna 2024, v den pátého výročí požáru.
